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看看娱乐app免费下载、免疫学研究所吴励课题组揭示表观遗传调控树突状细胞亚群命运决定的新机制

2023-12-01

2023年11月29日,看看娱乐app免费下载、免疫学研究所吴励教授课题组在期刊《eLife》上在线发表研究论文,题为“组蛋白去乙酰化酶3在浆细胞样树突状细胞命运决定过程中的调控作用”(Regulation of pDC fate determination by histone deacetylase 3)。该研究首次揭示了组蛋白去乙酰化酶HDAC3通过其去乙酰化的能力抑制cDC1相关基因的表达,促进pDC发育依赖的基因的表达,进而促进前体细胞向pDC发育分化,是DC命运决定过程中表观遗传调控机制的重要补充。

图.HDAC3调控DC亚群命运决定的分子机制

树突状细胞(DC)是免疫系统中重要的调控细胞,主要分为经典树突状细胞(cDC)和浆细胞样树突状细胞(pDC)。树突状细胞亚群在全身主要组织中广泛分布,在稳态下和免疫反应过程中行使多种复杂的功能。其中cDCs是启动特异性抗原免疫和诱导免疫耐受的专职抗原提呈细胞,而pDCs在病毒感染时是大量产生I型干扰素的主要细胞,促进机体的抗病毒免疫应答。

DCs起源于造血干细胞(HSCs),HSCs产生具有DC分化潜力的多能祖细胞(MPPs)。MPPs产生共同淋巴祖细胞(CLPs)和共同髓系祖细胞(CMPs),它们分别产生淋巴细胞和髓系细胞。CLPs和CMPs都有分化为DCs的潜力。目前已知DC发育及cDC和pDC亚群的命运决定受一系列转录因子和关键分子的调控,如PU.1、IRF8、IRF4、ID2、TCF4(E2-2)、MTG16、ZEB2、BCL11A等。尽管我们对DC发育中涉及的细胞因子、转录因子和祖细胞有了较深入的了解,但在DC亚群命运决定过程中的表观遗传调控机制仍然不清楚。

组蛋白去乙酰化酶(HDAC)家族通过催化组蛋白的去乙酰化过程改变染色质结构,抑制基因表达,是表观遗传调控网络中的重要成员。已有的研究表明HDAC家族在建立DC基因网络中起着关键作用。然而,具体哪个HDAC家族成员调控DCs的发育尚不明确。公开数据库的信息表明Hdac3在pDC中表达水平显著高于其他免疫细胞,且HDAC3在造血干细胞的分化及淋巴系T、B细胞的发育过程中发挥重要调控作用,提示HDAC3也可能参与调控pDC的发育或功能。

为了进一步探究HDAC3对DC发育的调控作用,作者构建了不同类型的Hdac3条件性敲除小鼠。通过他莫昔芬诱导在造血系统早期敲除Hdac3的小鼠(Hdac3f/fCreERT2)中发现pDC的数目显著减少,而cDC的变化相对较小,且该小鼠的骨髓细胞重建pDC的能力也显著降低。在DC发育分化后期敲除Hdac3的小鼠(Hdac3f/fItgax-Cre)中发现,pDC和cDC的发育分化均未受明显影响。这表明HDAC3以细胞内源性方式调控pDC发育,且主要作用于DC发育路径的早期阶段。

进一步研究发现,Hdac3缺失的小鼠中造血前体细胞发育受损,且pDC发育相关基因的表达水平显著降低,而与cDC分化相关的基因明显升高,因而导致前体细胞向pDC分化的能力显著降低。与此同时,在Hdac3缺失的前体细胞中过表达去乙酰化酶失活的点突变HDAC3并不能回复其分化为pDC的能力,表明HDAC3对DC发育的调控依赖其去乙酰化酶的活性。此外,对染色质乙酰化修饰水平的分析显示HDAC3通过组蛋白去乙酰化酶作用调控DC发育关键基因,如Zfp366Zbtb46Batf3等的H3K27Ac修饰水平,进而调控基因的表达水平和DC亚群的命运决定。

综上所述,本研究揭示了HDAC3通过组蛋白去乙酰化酶作用在DC前体细胞发育及pDC分化过程中的重要作用,进一步完善了表观遗传调控在DC亚群命运决定过程中的调控机制。

看看娱乐app免费下载免疫学研究所的2014级博士毕业生张艺君、博士后吴韬及何智敏为本文的共同第一作者,吴励教授为本文的通讯作者。该研究组的2011级博士毕业生赖文龙,博士后吕娇燕以及2020级在读博士生王源浩和2017级清华医学实验班学生沈相宜也为本研究做出重要贡献。本研究得到看看娱乐app免费下载免疫学研究所实验平台、看看娱乐app免费下载动物中心的大力支持,同时受到清华-北大生命联合中心、国家自然基金及科技部国家重点研发计划等项目资助。

原文链接:https://elifesciences.org/articles/80477

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